植物細胞の形状から直近の分裂を推定する手法

娘細胞が共有する壁の接合角度に着目

研究グループは、シロイヌナズナ葉原基のライブイメージングを正解データとして、隣接する7,573組の細胞について49種類の形状特徴を解析したと説明している。
その結果、娘細胞が共有する細胞壁の両端に現れる接合角度が、分裂推定に最も有効だったとしている。
平均接合角度145°以上を基準にした場合、適合率94.1％、再現率92.5％を示し、茎頂分裂組織では適合率98.4％、再現率97.2％だったと報告した。

研究グループによれば、植物細胞がどの方向に分裂したかの分析には、多大な時間と実験条件の検討が必要だったという。
今回の精度と直接比較できる従来の数値は、提供資料には示されていない。

共同研究グループは、細胞壁の接合角度を重要な特徴量として、染色した顕微鏡画像1枚から直近の植物細胞分裂を推定する手法を定量的に検証したと発表した。
変異体や非モデル植物への応用可能性と、解析ソフトウェアの公開も報告している。

報告された結果が再現されれば、分裂そのものをライブ観察しなくても、1枚の顕微鏡画像から最近の分裂パターンを推定する手掛かりになり得る。
ライブイメージング由来の正解データと照合して検証した点と、解析ソフトウェアを公開した点が、この手法の検討を広げる要素となる。